トレーニングコースの目的と概要。
画像解析は画像データから有用な情報を抽出するために必須の手段であり,近年の生物科学分野における諸課題を解決するためには欠くことのできないものとなっています.画像解析は,顕微鏡等による画像取得から各種画像処理を経て,可視化データや数値結果の出力に至るまで,様々な過程で構成されます.
最適な結果を褐るためには,各過程の理論的背景を理解したうえで,生物画像の解析に適した要素技術を選択し,効果的に組み合わせていかなければなりません.しかし,一般的な生物学の大学・大学院教育において,このような内容を体系立てて学ぶ機会は多くはないため,研究に必要な画像情報学の基礎事項を習得し,実践していけるような学習の機会が求められています.
これまで,愛知県岡崎市の基礎生物学研究所で「生物画像データ解析トレーニングコース」を行ってきましたが,今後,より多くの方々のニーズに対応するため日本各地を巡回する出張トレーニングコースを企画しました.
今年度は,東北・北海道近隣の学生や研究者の方々の参加がより便利になるよう,北海道大学で実施することになりました.
本トレーニングコースでは,画像解析アルゴリズムの基礎原理の講義からはじめ,生物画像処理に用いられるフィルタの設計や目的に応じた解析技術の適用に関して実習していきます.そしてそれらを踏まえ,ImageJのマクロ作成(プログラミング)による時系列データの処理等,より実践的な画像解析技術の実習を実施します.また,画像解析を念頭においた画像取得手法など,顕微鏡イメージングの拮礎についても講義していきます.受講者自らが今後の研究に活用できるような画像解析の拮礎固めを行うことを日的とし,標準的な生物画像解析の理論や技術の習得をめざします.
自然科学研究機構 新分野創成センター ABiS生物画像解析トレーニング担当
ABiS生物画像解析トレーニングコース – ImageJを用いた画像データーの処理と解析
- 日程: 2017年7月5日(水曜) – 6日(木曜)
- 場所: 北海道大学 電子科学研究所 会議室.
(会場の場所は、上記URLをご覧ください) - 主催: 新学術領域研究・学術研究支援基盤形成:先端バイオイメージング支援プラットフォーム(ABiS)
- 共催: 北海道大学 電子科学研究所 ニコンイメージングセンター
受付
7月5日 12:00 – 13:00
はじめに
13:00 – 13:05 木森 義隆 (基礎生物学研究所)
ABiS支援事業の説明
13:05 – 13:15 上野 直人 (基礎生物学研究所)
講義と演習
13:15 – 17:00 木森 義隆 (基礎生物学研究所)
「生物画像処理・解析の基礎(講義と演習)」
講義
17:00 – 18:00 村田 隆 (基礎生物学研究所)
「画像解析を目的としたイメージングの基礎」
講義と演習
7月6日 9:00 – 12:00 野中 茂紀 (基礎生物学研究所)
「ImageJ マクロ演習(1)」
講義と演習
13:00 – 16:00 加藤 輝 (基礎生物学研究所)
「ImageJ マクロ演習(2)」
質疑・応答
16:00 – 16:30 木森・加藤・野中・村田
- 役職、所属などは、開催当時の記載となります。